器官移植中心&肝胆胰外科二病区始建于2005年7月，在我国著名外科专家耿小平教授的带领下，经过10余年的发展，已成为省内领先的肝移植中心，并承担全省复杂疑难肝胆胰外科疾病的诊疗工作。
  现任科室主任赵红川教授，主任医师，安徽省学术和技术带头人，全国“五一”劳动奖章获得者，全国卫生计生系统先进工作者，美国耶鲁大学附属 Yale New Haven Hospital（YNHH）器官移植中心、德国鲁尔大学附属St. Josef hospital胰腺外科访问学者；兼任中华医学会外科学分会手术学组委员，中华医学会器官移植分会儿童器官移植学组委员，中华医学会器官移植分会器官捐献学组委员，中国医师协会器官移植医师分会委员，中国医院协会器官获取与分配工作委员会常委，安徽省器官移植医师分会主任委员，安徽省器官移植质控中心副主任，安徽省肝病学会常委，安徽省外科学会委员；兼任《中华器官移植杂志》，《肝胆外科杂志》，《器官移植》杂志编委；专业方向为：临床器官移植和肝胆胰外科，研究方向为：肝移植/肝癌临床与基础研究。
  科室核定床位28张，医师9人，博士学位5人，硕士学位4人，副高以上5人，主治2人，住院医2人；护士15人，副主任护师1人，主管护师9人。
  作为安徽省最早开展肝移植的科室，肝移植技术逐渐成熟，近年来完成肝移植手术居于省内领先、国内先进地位，率先在安徽省成功开展肝肾联合移植/儿童肝移植/再次肝移植/活体肝移植/劈离式肝移植/减体积肝移植/改良背驮式肝移植/各种肝动脉重建肝移植/门静脉取栓肝移植等多种复杂肝移植技术，年完成各种类型肝移植40例左右，肝移植手术质控指标/CLTR数据报送质量指标/肝移植术后随访指标均显著高于全国平均水平。
  在常规开展临床肝移植和肝胆胰外科手术基础上，科室成功开展国内领先肝胆胰外科诊疗新技术和新手术，如：巨大肝癌“二步法肝切除术（ALPPS）”、结直肠癌肝转移一期切除术、复杂肝胆管结石外科综合治疗、IV型肝门部联合肝动脉门静脉切除重建、全肝血流阻断腔静脉隔绝下肝切除联合腔静脉癌栓切除术、胰十二指肠联合门静脉部分切除重建术、腹腔多器官联合切除治疗侵袭性腹腔恶性肿瘤、以及腹腔镜下肝部分切除术、胰体尾联合脾切除术、腹腔镜联合胆道镜取石术等微创新技术。近年来，科室开展了机器人辅助下肝胆胰手术，获得了良好的临床效果。
  科室骨干人员均有海外进修学习经历，近5年承担省部级科研课题4项：国自然青年项目1项，省自然1项，省级转化课题2项，荣获安徽省科技进步二等奖2项，三等奖1项，科室2016年荣获“安徽省青年文明号”称号，并连续多年被评为院级“优质护理单元”；科室副主任黄帆同志荣获“全国最美援外医生”荣誉称号，并入选安徽省学术和技术带头人后备人选。
  此外，科室每年还承担医学本科生、5+3学制临床医学学生、国际留学生MBBS、规培医生相关医学教育和住培医生师资培训工作。