北京大学肿瘤医院胃肠外科病区，成建于2005年11月，以胃肠肿瘤的规范化和个体治疗为临床工作和研究重点。精于胃癌和结直肠癌的标准根治手术及综合治疗。

北京大学肿瘤医院胃肠外科集临床、科研、教学为一体。在院内通过多学科中心与内科、放疗科、放射科、病理科、内镜室及基础科研等兄弟科室密切合作， 以患者的个体化治疗为宗旨，积极推广胃肠肿瘤的规范化手术、微创手术、腹腔热灌注化疗、新辅助化疗、围手术期营养评估及支持等综合治疗，建立快速康复外科理念，提倡人性化服务。科室主任季加孚教授近年来已牵头开展的进展期胃癌国内多中心新辅助化疗临床试验参加单位已有40余家，均为目前我国各地的胃癌治疗中心单位，开辟了我国胃癌临床研究的一个新平台，并与国内外10余个实验室建立了良好的合作关系。季加孚教授并作为项目负责人先后承担了国家“863”项目、“十一五”科技支撑计划、国家自然科学基金项目、北京市科委项目、北京大学人类疾病基因研究中心项目等多项重大课题的研究。研究方向主要以胃癌的临床治疗和分子机理为重点，与美国斯坦福大学合作研究胃癌特异基因表述谱，同期建立并完善了规范化标本采集及管理的肿瘤组织标本库。曾获北京市科技进步奖三等奖1项。先后在《Oncogene》、《PNAS》、《MBC》、《中华医学杂志》等国内外杂志上发表论文40余篇。承担硕士、博士、博士后以及进修医生的教学工作，注重因材施教和临床能力培训，已培养多名博士、硕士、博士后研究生有学科带头人。

北京大学肿瘤医院未来将建立亚洲一流的消化道肿瘤诊治中心，改善硬件，进一步整合各科室资源，提出中国人自己的消化道肿瘤治疗指南，吸引并培养潜在高端患者群，申办并办好胃癌诊治领域中的奥林匹克大会（IGCA）。